女捕头李一月赴西北查案与北海龙三太子童灵相识互生情愫，却被上仙的心魔魇设计反目成仇。月老为保住二人性命，抹除其记忆，二人从此分离。三年后，李一月与童灵意外相逢，二人阴差阳错下再次爱上对方，并携手消灭魇

明朝末年，东厂的宦官们一度权倾朝野，但是公道自在人心，随着越来越多的人团结反抗，宦官当权的局面逐渐走到了尽头。实时朝廷内斗，太子在六扇门捕神的照顾下躲避，下落不明。东厂势力大肆追捕，势要抓住太子，以夺

京城名捕潘天柱矮小精干断案如神，“五尺神探”的美名远扬。然而临近退休的他快十年无案可破，闹剧频出，总捕头不愿再留他在六扇门惹是生非，贬他去雾镇当捕头。初来乍到的潘天柱便察觉到这表面祥和的小镇实则怪异得

一伙神秘匪徒意欲在即将举行的祭天盛典上行刺皇帝，六扇门必须在此之前将该案破获。种种线索指向襄阳的苍生客栈，当玄武小组赶到时，一伙匪徒竟将整个客栈的客人劫为人质——而他们的目标，却在所有人的预想之外……

京城出现天启通宝的假币，皇帝大怒，命六扇门彻查此事，玄武小组成员奉命调查此事，顺藤摸瓜发现巨贾柳百川与假币案有千丝万缕的联系，随着调查的深入，他们发现了柳百川的另一个身份，也由此离真相更近了一步。

大金使节达哈苏出使大明以求两国平和，六扇门接到使命护卫。却不料达哈苏抵达后，其副手俄然发问，里应外合占据了六扇门，目的是要杀死达哈苏，挑起两国战役。面临沦亡，同门惨遭屠杀，玄武小组打开拼死的激战。

专门关押监犯的黑山监狱年久失修，欲将监犯搬运，六扇门接到任务帮忙。张一带着唐珂前往预备，不料监狱中临时关押的两个女犯却引来了一批奥秘杀手血洗铁牢，张一和唐珂无可奈何联合狱中监犯一起抗敌，等待救援……

神秘杀手杀死琴馆盲女，引出了逃亡在外的唐珂。追查中张一发现，仍有十枚毒火球流落江湖，并被一个女杀手计划用来除掉朝中反对魏忠贤的一干忠臣！危急时刻，玄武小组再次出战，而唐珂也由此将了结唐门的血海深仇。

　　张一奉命执行一项任务，不想却中了圈套。周冲带着祝英前去营救，里应外合救出张一，并从倭寇手中救出数名村民，将倭寇头子竹下一郎正法，投敌叛国的将军刘猛受到惩罚。周冲和张一祝英正式组成“玄武”小组。

高丽叛军突起，大明援其火器并由高丽将军崔代元押送，不料途中被劫，六扇门玄武小组调查发现是监守自盗盖因崔之义女被叛军绑架，陷崔于两难境地。玄武小组为崔打动，誓在追回火器的同时救出人质，保其忠义两全！

　　北宋徽宗年间，镇远大将军凌落石与当朝奸相蔡京相互勾结，狼狈为奸，致使朝纲败坏，国势日衰。身兼武林大联盟副盟主的凌落石，更因觊觎武林盟主宝座，而趁盟主冷悔善过寿时，将其杀害，取而代之，冷悔善幼子冷血

　　巍巍京城，气势磅礴。时有捕神（成泰燊 饰）率领的六扇门，高手云集，作风凌厉，成为朝廷只手遮天的人物。是时京城伪造铜币泛滥，六扇门头号捕快冷血（邓超 饰）策划抓捕疑犯，结果在醉月楼与另一组人马大打出